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GET HELP
High Performance & Scientific Computing

Available Software



Introduction

The Secure Enclave has an extensive library of software available for your use. To learn more about a specific package, follow the links below. To request a software package be installed contact the OIT Help Desk (see https://help.utk.edu/). Please see the output of the “module avail” command for a more complete set of software installed either on the Open Enclave or Secure Enclave resources.

  • AMET
  • ATLAS
  • BSG
  • CAMX
  • CHEMPS2
  • DIAMORSE
  • DICE
  • GD
  • ISIS
  • MACS2
  • MCIP
  • MYSQL
  • ORTHOFINDER
  • REVBAYES
  • SRATOOLKIT
  • SU2
  • VTK
  • WGRIB
  • WRF-CHEM
  • WRF-WPS
  • ABINIT
  • ACF-LICENSE-MAN
  • AFNI
  • ALIPHYSICS
  • ALIROOT
  • ANACONDA2
  • ANACONDA3
  • ANT
  • ARMADILLO
  • ARPACK-NG
  • ASTRA-TOOLBOX
  • AUGUSTUS
  • AUTOMAKE
  • BANDUP
  • BBCP
  • BEDTOOLS
  • BIOPYTHON
  • BLAST
  • BOOST
  • BOWTIE2
  • BUSCO
  • BWA
  • BX-PYTHON
  • BZIP2
  • CAFFE
  • CAFFE2
  • CANU
  • CMAKE
  • CMAQ
  • CMAQ2CAMX
  • COGSOFT
  • COPASI
  • CWORLD-DEKKER
  • DAAL
  • DAKOTA
  • DASK
  • DEEPTOOLS
  • DIAMOND
  • DMTCP
  • DOS2UNIX
  • DPLASMA
  • EIGEN
  • ELSA
  • EMACS
  • EPACTS
  • ESPRESSO
  • ESPRESSOMD
  • FASTME
  • FASTQC
  • FASTTREE
  • FERAM
  • FFMPEG
  • FFTW
  • FLEX
  • GAP2SEQ
  • GEANT4
  • GET_HOMOLOGUES_EST
  • GIT
  • GLOG
  • GLPK
  • GMP
  • GNUPARALLEL
  • GNUPLOT
  • GO
  • GOPENMOL
  • GPFLOWOPT
  • GRACE
  • GRAPHVIZ
  • GROCSVS
  • GROFF
  • GROMACS
  • GSL
  • GSTREAMER
  • GTDBTK
  • GTK-DOC
  • GUROBI
  • HADOOP
  • HDF5
  • HDF5-PARALLEL
  • HIC-PRO
  • HIGLASS
  • HMMER
  • HPC-BLAST
  • HTSEQ
  • HTSLIB
  • HUMANN2
  • HWLOC
  • HYPRE
  • ICED
  • IDBA
  • IMAGEIO
  • IMAGEMAGICK
  • IMBALANCED-LEARN
  • IOAPI
  • IPM
  • IQ-TREE
  • ITSTOOL
  • JAVA
  • JELLYFISH
  • JULIA
  • KERAS
  • KERAS-TCN
  • KNEADDATA
  • LADSPA_SDK
  • LAMMPS
  • LAPACK
  • LEFSE
  • LEPTONICA
  • LIBGD
  • LIBIEC61883
  • LIBTIFF
  • LIBXLS
  • LIFELINES
  • LIGGGHTS
  • LISENSE
  • LLVM
  • LUSCUS
  • MAFFT
  • MATPLOTLIB
  • MAVEN
  • MCL
  • MEGAN
  • MERCURIAL
  • MESA
  • METIS
  • MLXTEND
  • MOLCAS
  • MOLDEN
  • MONGODB
  • MONGODB-COMPASS
  • MONO
  • MOTHUR
  • MPC
  • MPFR
  • MPICH
  • MUMMER
  • MUSCLE
  • MXML
  • NAMD
  • NCBI-VDB
  • NCO
  • NCVIEW
  • NEPER
  • NETCDF
  • NEXTFLOW
  • NGS
  • NLOPT
  • NMAP
  • NUMPY
  • NWCHEM
  • OCAML
  • OPAM
  • OPENBLAS
  • OPENDIEL
  • OPENBABEL
  • OPENCV
  • OPENFOAM
  • OPENMPI
  • P4VASP
  • PAIRIX
  • PAIRSAMTOOLS
  • PANDOC
  • PAPI
  • PARAVIEW
  • PARMETIS
  • PBGZIP
  • PCRE
  • PDFTK
  • PERL
  • PHYML
  • PLANETOCOSMICS
  • PLASMA
  • PLOTICUS
  • POSTGIS
  • POSTGRESQL
  • POVRAY
  • PRODIGAL
  • PROKKA
  • PROTTEST
  • PSI4
  • PYCGNS
  • PYGRAPHVIZ
  • PYMONGO
  • PYQTGRAPH
  • PYSAM
  • PYSCF
  • PYTHIA
  • PYTHON
  • PYTHON3
  • Q-ESPRESSO
  • QCMAQUIS
  • QIIME2
  • QMCPACK
  • R
  • RAXML
  • ROOT
  • RSTUDIO
  • RUBY
  • SAMTOOLS
  • SBT
  • SCALA
  • SCALAPACK
  • SCIKIT-IMAGE
  • SCIKIT-LEARN
  • SCONS
  • SIESTA
  • SILO
  • SINGULARITY_R_STUDIO
  • SKEWER
  • SKREBATE
  • SMOKE
  • SPADES
  • SPARK
  • SPDLOG
  • SPRNG
  • ST2
  • STACKS
  • STAR
  • STATA
  • STATSMODELS
  • SUBVERSION
  • SWIG
  • SZIP
  • TENSORFLOW
  • TENSORFLOW-GPU
  • TESSERACT
  • TEXINFO
  • TEXLIVE
  • THEANO
  • TIFFFILE
  • TOPHAT
  • TRANSDECODER
  • TRANSRATE
  • TRIMMOMATIC
  • TRINITY
  • TURBOMOLE
  • UDUNITS
  • USEARCH
  • UTF8PROC
  • VALGRIND
  • VASP
  • VMD
  • VSEARCH
  • XALT
  • XGBOOST
  • XML2
  • XPDF
  • XZ
  • ZEPPELIN
  • ZLIB